Istražni zatvor dopušteno je odrediti samo u slučaju u kojem postoji visok stupanj vjerojatnosti utvrđenja krivnje i izricanja kazne, to jest u kojem postoji "osnovana sumnja" da je osoba počinila kazneno djelo, te, načelno, samo u cilju osiguranj...

U slučaju primjene »novog« Zakona o kaznenom postupku iz 2008., nalog o provođenju istrage morao bi donijeti nadležni državni odvjetnik, a rješenje o istražnom zatvoru »sudac istrage«, u postupku i prema pravnim pravilima »novog« Zakona