Proračunski korisnici i jedinice lokalne i područne (regionalne) samouprave kao primatelji EU pomoći imaju obvezu dio svog financijskog i računovodstvenog poslovanja prilagoditi pravilima korištenja europskih strukturnih i investicijskih fondova i ostalih programa EU-a. Također, sukladno odredbama Zakona o proračunu i drugih akata koji uređuju proračunsko računovodstvo, imaju i obvezu pravilnog planiranja, evidentiranja i izvještavanja o primljenim sredstvima.